Carbapenemasas en aislamientos de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenémicos aisladas en hospitales de Chile

Resumen Introducción: La resistencia a carbapenémicos mediada por carbapenemasas en Pseudomonas aeruginosa es un mecanismo importante; sin embargo, la pérdida de la porina OprD continúa siendo el mecanismo más frecuente. Objetivo: Determinar la proporción de aislados de P. aeruginosa, resistentes a imipenem y/o meropenem, productores de carbapenemasas, el tipo de enzima producida y la relación genética entre los aislados. Material y Métodos: Se incluyó 113 aislados resistentes al menos a un carbapenémico, provenientes de 12 hospitales de 9 ciudades de Chile. Adicionalmente se determinó la susceptibilidad a ceftazidima, amikacina, gentamicina, piperacilina/tazobactam, ciprofloxacina y colistina. Se realizó Carba NP y en los aislados positivos (n: 61) se detectó genes de carbapenemasas por RPC. Los aislados fueron tipificados por restricción con SpeI y PFGE. Resultados: No todos los aislados presentan carbapenemasas, y sólo en 61/113 de ellos (54%) se amplificó blaKPC (32) o blaVIM (29). En ninguno de los aislados se encontró co-portación de ambos genes. Los pulsotipos indican que no hay diseminación clonal de los aislados, evidenciando una importante diversidad genética. Conclusiones: Los aislados de P. aeruginosa productores de carbapenemasas, obtenidos en hospitales de Chile, portan genes blaKPC y blaVIM y, en su mayoría, son policlonales. Estos resultados ponen énfasis en la importancia de realizar estudios epidemiológicos con mayor número de aislados que permitan conocer mejor la epidemiología de P. aeruginosa productoras de carbapenemasas en Chile.

Abstract Background: Carbapenem resistance mediated by carbapenemases in Pseudomonas aeruginosa is an important mechanism; however, loss of porin OprD remains as the most frequent. Aim: To determine the proportion of P. aeruginosa isolates, resistant to imipenem and/or meropenem, producing carbapenemases, the type of enzyme produced and the genetic relationship between the isolates. Methods: One hundred and thirteen resistant to at least one carbapenem isolates, obtained in 12 hospitals and 9 cities in Chile were studied. Additionally, susceptibility to ceftazidime, amikacin, gentamicin, piperacillin/tazobactam, ciprofloxacin and colistin was determined. Carba NP was performed and in the positive isolates carbapenemase genes were detected by PCR. The isolates were typified by restriction with SpeI and PFGE. Results: Not all isolates produce carbapenemases, and only in 61/113 of them (54%) the blaKPC (32) or blaVIM (29) was amplified. In none of the isolates was found the coharboring of both genes. The pulsotypes indicated no clonal dissemination of the isolates, evidencing an important genetic diversity. Conclusions: P. aeruginosa isolates producing carbapenemases, obtained in Chilean hospitals carry blaKPC and blaVIM genes and, mostly, are polyclonal. These results emphasize the importance of carrying out epidemiological studies with a greater number of isolates to allow a better understanding of the epidemiology of carbapenemase-producing P. aeruginosa in Chile.

Genes de resistencia en cepas bacterianas asociadas a infecciones en una institución prestadora de servicios de salud del departamento de Boyacá / Genes of resistance in bacterial strains associated with infections in a health services providing institution of the department of Boyacá

RESUMEN Objetivo: Determinar la presencia de los genes de resistencia en cepas bacterianas asociados a infecciones en una IPS de segundo nivel del municipio de Duitama (Boyacá). Materiales y métodos: Se llevó a cabo un estudio observacional, descriptivo de corte transversal; se confirmó la identificación y el fenotipo de la resistencia de acuerdo con la guía CLSI M100-S23 del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI); se hizo el análisis molecular de la presencia de los genes que codifican resistencia en cepas gram negativas y positivas. Resultados: El estudio mostró una prevalencia de genes de resistencia en 91,7% de las muestras evaluadas (33/36), siendo blaTEM el más frecuente está presente en 33 cepas (91,7 %), seguido por blaCTXM1 36,1 % y blaSHV con 27,8% de frecuencia. Para la frecuencia de los genes en S. aureus, se pudo evidenciar que 37.5 % de las cepas presentaron el gen blaZ y 32,5 % el gen mecA; resultados que confirman la presencia de genes que codifican este tipo de resistencias y se convierten en el principal mecanismo responsable de infecciones en pacientes hospitalizados. Conclusión: La genotipificación bacteriana permitió confirmar la presencia de clones con resistencia tipo BLEE en el 92 % de las cepas Gram negativas (E. coli y K. pneumoniae) y en el 37 % de las cepas Gram positivas (S. aureus), por lo cual es necesario mantener la vigilancia de estas cepas a fin de evitar posibles brotes causados por estos microorganismos resistentes.

ABSTRACT Objective: Determine the presence of resistance genes in bacterial strains associated with infections in a second-level IPS in Duitama City, Department of Boyacá. Materials and methods: An observational, descriptive cross-sectional study was carried out. Subsequently, the identification and phenotype of the resistance was confirmed according to the CLSI guide M100-S23 of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Molecular analysis to identify the presence of genes for bacterial resistance was done in both gram-negative and Gram-positive strains. Results: The study showed a prevalence of resistance genes in 91.7 % of the samples evaluated (33/36), blaTEM was the most frequent gene being present in 33 strains (91.7 %), followed by blaCTXM1 36.1 % and blaSHV with 27.8 %. For the frequency of the genes in S. aureus, it was evidenced that 37.5% of the strains presented the blaZ gene and 32.5 % the mecA gene, results that confirm the presence of genes that encode this type of resistance and become the main mechanism responsible for infections in hospitalized patients. Conclusion: The bacterial genotification allowed to confirm the presence of clones with resistance type fi-lactamasas extended spectrum (ESBL) in 92 % of the Gram negative strains (E. coli and K. pneumoneae) and in 37 % of Gram positive strains (S. aureus), which is why it is necessary to maintain the surveillance of these strains in order to avoid possible outbreaks caused by these resistant microorganisms.

Diversidad molecular de variantes patogénicas de Vibrio parahaemolyticus en el Perú / Molecular diversity in pathogenic variants of vibrio parahaemolyticus in Peru

RESUMEN Con el objetivo de determinar la diversidad de variantes patogénicas de Vibrio parahaemolyticus en el Perú durante el periodo 1995-2017, se analizaron 102 genomas peruanos (97 clínicos y 5 ambientales) empleando el esquema de tipificación multilocus y BLASTn para la búsqueda de genes de virulencia. Se identificaron 15 tipos de secuencia diferentes, encontrándose que el genotipo ST3, perteneciente al clon pandémico, fue el más abundante, con 52% (n=53); seguido por el ST120, con 23,5% (n=24); y el complejo clonal CC345, con 11,8% (n=12). Un total de 89 cepas analizadas presentaron genes que codifican la isla de patogenicidad VpaI-7 (87,3%), mientras que 96 presentaron el gen tdh (94,1%), y 6, el trh (5,9%). Durante el periodo evaluado, se resalta la predominancia del ST3, causante de un importante brote en el pasado del Perú, además de otros genotipos patógenos que representan un riesgo latente en salud pública asociado al consumo de alimentos marinos.

ABSTRACT During the period from 1995 to 2017, in order to determine the diversity of Vibrio parahaemolyticus pathogenic variants in Peru, 102 Peruvian genomes (97 from a hospital setting and 5 from an out-of-hospital setting) were analyzed using the multilocus typification scheme and BLASTn in the search for virulence genes. Fifteen different sequence types were identified. It was found that the ST3 genotype, which is found in the pandemic clone, was the most abundant, with 52% (n=53); followed by ST120, with 23.5% (n=24); and the CC345 clonal complex, with 11.8% (n=12). A total of 89 analyzed strains presented genes encoding the pathogenicity island VpaI-7 (87.3%), while 96 presented the tdh gene (94.1%), and 6 the trh gene (5.9%). The ST3 genotype was the predominant one during the evaluated period, this genotype was the cause of a major outbreak in Peru's past history. Other pathogenic genotypes found represent a latent public health risk associated with seafood consumption.

Identificación de especies de Leishmania en pacientes derivados al Instituto Nacional de Salud del Perú / Identification of Leishmania species in patients derived to the National Institute of Health, Peru

RESUMEN En el Perú, la leishmaniasis es una enfermedad metaxénica que representa un serio problema de salud pública, debido a su amplia distribución y al número de personas en riesgo de contraer la enfermedad, siendo la población vulnerable principalmente las personas de bajos recursos económicos. El estudio se realizó a partir de pacientes que fueron derivados al Instituto Nacional de Salud entre el 2006 y el 2011 para que se les realizara el diagnóstico especializado. La identificación de la especie de Leishmania infectante se desarrolló mediante el análisis de las curvas de disociación (HRMA) obtenidas a partir del ADN genómico de promastigotes y amastigotes, lo que permitió identificar las especies de Leishmania (Viannia) braziliensis, Leishmania (V.) guyanensis, Leishmania (V.) peruviana como las más prevalentes, además de Leishmania (V.) lainsoni y Leishmania (L.) amazonensis.

ABSTRACT In Peru, leishmaniasis is a metaxenic disease that represents a serious public health problem, due to its wide distribution and the number of people in danger of contracting the disease, being the vulnerable population mainly those with low economic resources. The study was conducted from patients who were derived to Peru's National Institute of Health between 2006 and 2011 so that the specialized diagnosis could be carried out. The identification of the species of infectious Leishmania was developed through the analysis of the High-Resolution Melting Analysis obtained from the genomic DNA of promastigotes and amastigotes, which allows to identify the species of Leishmania (Viannia) braziliensis, Leishmania (V.) guyanensis, Leishmania (V.) peruviana as more prevalent, in addition to Leishmania (V.) lainsoni and Leishmania (L.) amazonensis.

Polimorfismo de los antígenos leucocitarios humanos en receptores cubanos de trasplante relacionado de progenitores hematopoyéticas / Polymorphism of human leukocyte antigens in Cuban recipients of related hematopoietic stem cell transplants

Introducción: El trasplante relacionado de células progenitoras hematopoyéticas (TCPH) es una alternativa terapéutica curativa para los pacientes con ciertos tipos de hemopatías o de inmunodeficiencias, en la que se selecciona como donante a un familiar del receptor. Objetivo: Caracterizar el sistema de antígenos leucocitarios humanos (HLA) en receptores de TCPH relacionado. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo y transversal en el departamento de Histocompatibilidad del Instituto de Hematología e Inmunología desde enero 2013 hasta diciembre de 2015. Se tipificaron 75 genes HLA mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa con cebadores de secuencia específico, de baja resolución a 117 pacientes con criterio de TCPH. Para el análisis inmunogenético se empleó el programa Arlequín 3.5.2.2. Resultados: Fueron más frecuentes los genes HLA-A*02, HLA-B*35, HLA-DQB1*03, HLA-DRB1*03 y HLA-DRB1*04, los haplotipos de dos loci HLA-A*02 B*35, HLA-DQB1*03 DRB1*04 y el haplotipo extendido HLA-A*03 B*07 DQB1*06 DRB1*15. Conclusiones: Los genes del sistema HLA en pacientes cubanos candidatos a TCPH relacionado presentaron frecuencias similares a las descritas en poblaciones generales de Cuba y el mundo, aunque con características distintivas en algunos genes y haplotipos(AU)

Introduction: Related hematopoietic progenitor cell (TCPH) transplantation is a curative therapeutic alternative for patients with certain types of hemopathies or immunodeficiencies, in which a recipient family member is selected as a donor. Objective: To characterize the human leukocyte antigen (HLA) system in related TCPH receptors. Methods: A descriptive and cross-sectional study was conducted in the Histocompatibility department of the Institute of Hematology and Immunology from January 2013 to December 2015. 75 HLA genes were typed using the polymerase chain reaction technique with specific sequence primers, from Low resolution to 117 patients with TCPH criteria. For the immunogenetic analysis, the Harlequin 3.5.2.2 program was used. Results: The genes HLA-A * 02, HLA-B * 35, HLA-DQB1 * 03, HLA-DRB1 * 03 and HLA-DRB1 * 04, the haplotypes of two HLA-A * 02 B * 35 loci were more frequent , HLA-DQB1 * 03 DRB1 * 04 and the extended haplotype HLA-A * 03 B * 07 DQB1 * 06 DRB1 * 15. Conclusions: The genes of the HLA system in Cuban patients related to TCPH presented frequencies similar to those described in general populations of Cuba and the world, although with distinctive characteristics in some genes and haplotypes(AU)

Mucosal leishmaniasis: A forgotten disease, description and identification of species in 50 Colombian cases / Leishmaniasis mucosa: una enfermedad olvidada, descripción e identificación de especies en 50 casos colombianos

Abstract Introduction: Mucosal leishmaniasis has a progressive course and can cause deformity and even mutilation in the affected areas. It is endemic in the American continent and it is mainly caused by Leishmania (Viannia) braziliensis. Objective: To describe a series of mucosal leishmaniasis cases and the infectious Leishmania species. Materials and methods: We included 50 patients with a clinical diagnosis of mucosal leishmaniasis and parasitological confirmation, and we described their clinical and laboratory results. We performed species typing by PCR-RFLP using the miniexon sequence and hsp70 genes; confirmation was done by sequencing. Results: The median time of disease evolution was 2.9 years (range: 1 month to 16 years). The relevant clinical findings included mucosal infiltration (94%), cutaneous leishmaniasis scar (74%), total loss of the nasal septum (24%), nasal deformity (22%), and mucosal ulceration (38%). The symptoms reported included nasal obstruction (90%), epistaxis (72%), rhinorrhea (72%), dysphonia (28%), dysphagia (18%), and nasal pruritus (34%). The histopathological study revealed a pattern compatible with leishmaniasis in 86% of the biopsies, and amastigotes were identified in 14% of them. The Montenegro skin test was positive in 86% of patients, immunofluorescence in 84%, and culture in 8%. Leishmania (V.) braziliensis was identified in 88% of the samples, L. (V) panamensis in 8%, and L. (V.) guyanensis and L. (L.) amazonensis in 2% respectively. Conclusion: In this study, we found a severe nasal disease with destruction and deformity of the nasal septum in 25% of the cases, probably associated with late diagnosis. Leishmania (V.) braziliensis was the predominant species. We described a case of mucosal leishmaniasis in Colombia caused by L. (L.) amazonensis for the first time.

Resumen Introducción. La leishmaniasis mucosa tiene un curso progresivo y puede causar deformidad e incluso mutilación de las zonas afectadas. Es endémica en el continente americano y es causada principalmente por Leishmania (Viannia) brasiliensis. Objetivo. Describir una serie de casos de leishmaniasis mucosa y las especies de Leishmania infecciosas. Materiales y métodos. Se estudiaron 50 pacientes con diagnóstico clínico de leishmaniasis mucosa y confirmación parasitológica. Se describieron sus características clínicas y los resultados de laboratorio. La tipificación de especies se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa de los polimorfismos de la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism Polymerase Chain Reaction, PCR-RFLP) en la secuencia del miniexon y el gen hsp70 y se confirmó por secuenciación. Resultados. La evolución de la enfermedad fue de un mes a dieciséis años (mediana de 2,8 años). Los hallazgos clínicos fueron los siguientes: infiltración mucosa (94 %), cicatriz de leishmaniasis cutánea (74 %), pérdida total del tabique nasal (24 %), deformidad nasal (22 %) y ulceración (38 %). Los síntomas reportados fueron: obstrucción nasal (90 %), epistaxis (72 %), rinorrea (72 %), disfonía (28 %), disfagia (18 %) y prurito nasal (34 %). La histopatología mostró un patrón compatible con leishmaniasis en 86 % de las biopsias y se identificaron amastigotes en 14 % de ellas. La prueba de Montenegro fue positiva en 86 % de los pacientes, la inmunofluorescencia en 84 %, y el cultivo en 8 %. Leishmania (V.) brasiliensis se identificó en 88 % de las muestras, L. (V) panamensis en 8 %, y L. (V.) guyanensis y L. (L.) amazonensis en 2 %, respectivamente. Conclusión. Se encontró enfermedad nasal grave con destrucción y deformidad del tabique nasal en una cuarta parte de los casos, probablemente debido a un diagnóstico tardío. Leishmania (V.) brasiliensis fue la especie predominante. Se describe por primera vez un caso de leishmaniasis mucosa causado por L. (L.) amazonensis en Colombia.

Identificación molecular de Aspergillus fumigatus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva / Molecular identification of Aspergillus fumigatus isolated from patients with invasive aspergillosis

RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente cepas de aspergillus aislados de pacientes con aspergilosis invasiva (AI), que fueron tipificadas primariamente como Aspergillus fumigatus sensu lato por métodos fenotípicos convencionales. Se trabajó con 20 cepas de la micoteca de la sección de micología del Instituto de Medicina Tropical "Daniel A. Carrión". Para obtener el ADN fúngico se emplearon las técnicas de choque térmico, tratamiento enzimático y columnas de silica-gel; y se almacenó a -20 0C para conservarlo. En el procedimiento de la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qPCR) se incluyeron primers marcados con fluorocromo, los cuales amplificaron las secuencias específicas de A. fumigatus. La fluorescencia se midió con el termociclador al final de la fase de hibridación de cada ciclo. Se identificó molecularmente que sólo el 50% de las cepas estudiadas pertenecen a la especie Aspergillus fumigatus sensu stricto.

ABSTRACT The objective of the study was to identify molecularly-isolated strains of Aspergillus from patients with invasive aspergillosis (IA); these strains were primarily typed as Aspergillus fumigatus sensu lato by conventional phenotypic methods. We worked with 20 strains from the mycology section of the Institute of Tropical Medicine "Daniel A. Carrión." To obtain the fungal DNA, thermal shock, enzymatic treatment, and silica gel column techniques were used; and it was stored at -20°C to preserve it. The real-time polymerase chain reaction (qPCR) procedure included fluorochrome-labeled primers, which amplified the specific sequences of A. fumigatus. Fluorescence was measured with the thermocycler at the end of the hybridization phase of each cycle. It was molecularly-identified that only 50% of the strains studied belong to the species Aspergillus fumigatus sensu stricto.

Análisis MLVA y perfil de virulencia de aislamientos de Staphylococcus aureus resistentes a la meticilina adquiridos en la comunidad causantes de infecciones pediátricas en Paraguay

Staphylococcus aureus resistente a la meticilina adquirido en la comunidad (SARM-AC) es uno de los principales patógenos causantes de infecciones de piel y partes blandas, aunque también se lo implica en infecciones graves, como osteomielitis y neumonía. El objetivo de este estudio descriptivo fue determinar el tipo de cassette SCCmec, el perfil de virulencia y la variabilidad genética de 21 aislamientos de SARM-AC que infectaron a niños paraguayos en el año 2010. Se determinó por PCR el tipo de cassette SCCmec y los factores de virulencia, en tanto que la variabilidad genética se determinó por la técnica multiple locus variable analysis (MLVA). Todos los aislamientos (100%) presentaron cassette SCCmec IV; algunos portaron factores de virulencia como hla, hlb y sea (el 28,6, el 9,5 y el 4,8%, respectivamente). El análisis MLVA mostró gran variabilidad genética, con datos de antibiotipo y perfil de virulencia congruentes. Este trabajo pone de manifiesto por primera vez en Paraguay la presencia de SARM-AC portador del cassette SCCmec IV con elevada diversidad genética.

Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) is one of the first causes of skin and soft tissue infections, and can also produce severe diseases such as osteomyelitis and pneumonia. The aim of this descriptive study was to determine the SCCmec type and virulence profile and to study the genetic diversity by MLVA analysis of 21 CA-MRSA isolates that infected Paraguayan children in 2010. The SCCmec type and virulence factors were performed by PCR and genetic diversity by MLVA (multiple locus variable analysis). All the isolates carried SCCmec cassette IV. hla, hlb and sea genes were detected in 28,6%, 9,5% and 4,8% respectively. The MLVA analysis showed high genetic diversity with congruent antibiotic resistance and virulence profiles. This study revealed the presence of CA-MRSA harbouring SCCmec IV with high genetic diversity, providing information not available in our country.

Molecular typing of Leishmania (Leishmania) amazonensis and species of the subgenus Viannia associated with cutaneous and mucosal leishmaniasis in Colombia: A concordance study / Tipificación molecular de Leishmania (Leishmania) amazonensis y especies del subgénero Viannia asociadas a la leishmaniasis cutánea y la mucosa en Colombia: un estudio de concordancia

Resumen Introduction: Multilocus enzyme electrophoresis (MLEE) is the reference standard for the characterization of Leishmania species. The test is restricted to specialized laboratories due to its technical complexity, cost, and time required to obtain results. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) is used to identify Leishmania species. Objective: To establish the concordance between the two tests as identifying methods for circulating species in Colombia. Materials and methods: A total of 96 isolates from patients with cutaneous or mucosal leishmaniasis were selected and identified by MLEE and PCR-RFLP with miniexon and hsp70 as the molecular targets, which were used sequentially. Restriction enzymes HaeIII and BccI were similarly applied. Cohen's kappa coefficient and the 95% confidence interval (CI) were calculated. Results: The kappa coefficient and the 95% CI between MLEE and PCR-RFLP displayed "very good" concordance with a coefficient of 0.98 (CI95%: 0.98 to 1.00). The identified species were Leishmania Viannia braziliensis, Leishmania Viannia panamensis, Leishmania Viannia guyanensis and Leishmania Leishmania amazonensis. A total of 80 of the 96 isolates were sequenced and the results obtained by PCR-RFLP were confirmed. Conclusion: Due to the concordance obtained between tests results with the amplification of the genes miniexon and hsp70, PCR-RFLP is proposed as an alternative for identifying circulating Leishmania species in Colombia.

Abstract Introducción. La electroforesis de enzimas multilocus (Multilocus Enzyme Electrophoresis, MLEE) es el estándar de referencia para la tipificación de las especies de Leishmania. La prueba está restringida a laboratorios especializados por su complejidad técnica, sus costos y el tiempo necesario para obtener resultados. La PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism) se utiliza para tipificar especies de Leishmania. Objetivo. Establecer la concordancia entre las dos pruebas como métodos de tipificación de las especies circulantes en Colombia. Materiales y métodos. Se seleccionaron 96 aislamientos de pacientes con leishmaniasis cutánea o mucocutánea y se tipificaron mediante MLEE y PCR-RFLP con los blancos moleculares miniexon y hsp70 usados en serie. Las enzimas de restricción aplicadas fueron la HaeIII y la BccI, respectivamente. Se calculó el coeficiente kappa y un intervalo de confianza (IC) de 95 %. Resultados. Se determinó que la concordancia fue "muy buena" al obtener un coeficiente de 0,98 (IC95%: 0,98-1,00). Las especies identificadas fueron: Leishmania Viannia braziliensis, L. (V.) panamensis, L. (V.) guyanensis y L. (L,) amazonensis. De los 96 aislamientos, 80 se enviaron a secuenciación y se confirmaron los resultados obtenidos mediante PCR-RFLP. Conclusión. Dada la concordancia obtenida con la PCR-RFLP amplificando los genes miniexon y hsp70, se propone esta prueba como alternativa para la tipificación de especies de Leishmania circulantes en Colombia.

Estandarización del análisis multi-locus de número variable de repeticiones en tándem para el estudio de staphylococcus aureus resistentes a meticilina aislados de la comunidad en Paraguay / Multiple-locus variable-number of tandem repeat analysis standardization for community isolates methicilineresistant staphylococcus aureus study in Paraguay

Staphylococcus aureus es un patógeno capaz de causar infecciones con amplio rango de severidad y adaptarse a diferentes tejidos. Su epidemiología es compleja, por circulación de cientos de clones a nivel mundial, lo que requiere de métodos moleculares reproducibles y de alto poder discriminatorio para la identificación de los mismos. El presente estudio tuvo como objetivo principal la estandarización del análisis multi-locus de número variable de repeticiones en tándem (MLVA) para análisis de variabilidad genética de aislados de S. aureus previamente tipificados por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), gold standard para tipificación de aislados. La MLVA se realizó por amplificación de 7 locus VNTR (clfA, clfB, sdrC, sdrD, sdrE, sspA y spA) por PCR. Se alcanzó un alto nivel de reproducibilidad. El empleo de cepas previamente tipificadas por análisis de secuencias multi-locus (MLST), PFGE, locus spa y cassette SCCmec, permitió validar de forma comparativa el agrupamiento generado por MLVA. Los aislados que fueron agrupados como idénticos por MLVA presentaron resultados congruentes con la totalidad de las otras técnicas moleculares y esta demostró ser más sensible que PFGE para distinguir entre aislados que presentaron patrones PFGE idénticos. La MLVA cumple todos los criterios de un método de tipificación útil.

Staphylococcus aureus is a pathogen that can produce several infections with a wide range of severity and it has the ability to adapt to different tissues. The epidemiology is complex, due to circulation of many different clones worldwide, so the analysis for its identification requires reproducible and high discriminatory power molecular methods. The aim of this study was to standardize the molecular technique multiple-locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA) for the genetic variability analysis of S. aureus isolates, previously characterized by pulsed field gel electrophoresis (PFGE). The MLVA was made by PCR amplification of seven VNTR locus (clfA, clfB, sdrC, sdrD, sdrE, sspA y spA). A high level of reproducibility has been reached in the study. The use of isolates previously typified by multi-locus sequence typing (MLST), PFGE, locus spa and cassette SCCmec, allowed to validate the MLVA clusters comparatively. The isolates that were clustered by MLVA as the same isolate, showed the same results by other molecular techniques, and the MLVA can distinguish isolates with identical PFGE patterns. This technique meets all the criteria of a useful molecular typification technique.

Uso de la técnica de vntr-miru para el estudio de transmisión intrahospitalaria de tuberculosis en el Hospital Universitario de Caracas, 2010-2011 / Use the vntr-miru technique for the study of nosocomial transmission of tuberculosis at the Hospital Universitario de Caracas, 2010-2011

La tuberculosis es una enfermedad infecciosa, causada por especies del complejo Mycobacterium tuberculosis. Es una enfermedad de fácil transmisión, lo que puede generar un problema en los sitios de cuidado de salud al incrementarse el riesgo de infección entre las personas que se encuentran hospitalizadas, personal médico y visitante. El objetivo de este estudio fue tipificar mediante VNTR-MIRU 35 aislados de M. tuberculosis, obtenidos de pacientes recluidos en el Hospital Universitario de Caracas (HUC) durante 2010­2011, para establecer si existe estrecha relación genética entre los aislados y detectar si se presentó transmisión intrahospitalaria. En la tipificación por VNTR se observaron 29 patrones genéticos únicos (82,9%) y 3 clústeres, de los cuales sólo uno estuvo conformado por patrones genéticos de aislados provenientes de pacientes con estrecha relación epidemiológica (superposición de períodos de hospitalización). Mediante el análisis comparativo de los patrones genéticos con los depositados en la base de datos de VNTR-plus utilizando el método de Neighbor-joining, se pudo observar que los aislados se agrupaban con patrones LAM (n=25), Haarlem (n=3) y S (n=7). La conformación de un clúster de dos aislados de pacientes con un vínculo epidemiológico sugiere la posible transmisión nosocomial de la TB en el HUC

Tuberculosis (TB) is an infectious disease, caused by species from the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC). It is an easily transmitted disease that it can increase the risk of infection among people who are in hospital, medical staff and visitors The purpose of this study was to molecular typing by VNTR-MIRU 35 isolates of Mycobacterium tuberculosis (M.tb) from hospitalized patients in the "Hospital Universitario de Caracas" during 2010-2011 to establish whether there is a close genetic relationship between isolates and to detect whether the nosocomial transmission was presented. In the analysis of VNTR typing, 29 unique genetic patterns (82,9%) and 3 clusters were observed, of which only one consisted by genetic patterns of isolates from patient with close epidemiologic relation (overlapping of periods of hospitalization). With the comparative analysis of genetic patterns with VNTR-plus database using Neighbor-joining method it was possible to observe the clustering of the isolates with LAM (n=25), Haarlem (n=3), S (n=7). The forming of one cluster with two isolates from patients with epidemiological link suggests a possible nosocomial transmission of TB in HUC

Prevalencia y tipificación de genotipos de virus del papiloma humano en mujeres del área metropolitana del Valle de México / Prevalence and typing of human papilloma virus genotypes in women of the Metropolitan Area of the Valley of Mexico

Resumen Objetivo: determinar la prevalencia del virus del papiloma humano y describir los genotipos más frecuentes. Materiales y métodos: estudio descriptivo y ambispectivo efectuado en pacientes atendidas en la consulta externa del Hospital Militar de Especialidades de la Mujer y Neonatología, entre marzo y octubre de 2015, para prueba de PCR con fines de detección del virus del papiloma humano (Digene® HC2 DNA Collection Device). Resultados: se registraron 142 pacientes mujeres. La prevalencia del VPH fue de 9%. El 77% estaba en riesgo alto, de las que el serotipo 56 fue el más frecuente. El resto (33%) se clasificó con riesgo bajo (n = 3) de diferente tipo, pero ninguno 6 u 8. En cuanto a la diferencia de medias con t de Student para el número de parejas sexuales y edad, respecto del resultado de la prueba de PCR, no se obtuvieron resultados estadísticamente significativos. Conclusiones: la prevalencia del virus del papiloma humano varía entre los diferentes estudios realizados en México. En el sistema de salud se requiere un programa organizado para poder disminuir la prevalencia del VPH.

Abstract Background: Human papilloma virus (HPV) is considered the most important risk factor, associated to cervical cancer, more tan 90% of the cervical cancer cases have some DNA strains of the virus, and the most prevalent of the genotypes is the 16, followed by genotype 18. The use of biological tests has been successful in the opportune diagnosis of the infection. These techniques are based in the recognizement of HPV DNA by PCR. Objective: This study aims to determine the prevalence of HPV and the most frequent genotypes in our population. Methodology: This study was realized in patients whom accepted the realization of the PCR test, in the Hospital Militar de Especialidades de la Mujer y Neonatología in the Mexico city, prospectively from march 2015 to october 2015. The main inclusion criteria was age above 35 years, lack of HPV disease previously diagnosed and all of them lived in the center of the country. Results: 142 female patients were analyzed. The prevalence obtained was 9%, 77% were at high risk, of which serotype 56 were the most frequent. The remaining 33% were classified as low risk, with only 3 cases, all had different genotypes, but none of them had 6 or 8. Conclusions: The Human Papilloma Virus prevalence varies among different studies in our country, as well as those performed worldwide. The existence of an organized system in our health care system may be one of the main contributors of our relative low prevalence.

Discriminación genotípica de serovariedades del serogrupo Icterohaemorrhagiae pertenecientes a Leptospira interrogans (Spirochaetales: Leptospiraceae) y el análisis de distancias génicas mediante coordenadas principales

La leptospirosis es una zoonosis de amplia distribución mundial y de importancia en salud pública y veterinaria. El serogrupo Icterohaemorrhagiae toma importancia, ya que ha sido aislado con frecuencia en roedores y en casos clínicos de humanos, caninos, bovinos y porcinos; y se ha logrado aislar a partir de agua del rio Reconquista, provincia de Buenos Aires, Argentina. El objetivo de este estudio fue discriminar molecularmente entre las serovariedades Copenhageni e Icterohaemorrhagiae del serogrupo Icterohaemorrhagiae de importancia en Argentina, utilizando la técnica del análisis de repeticiones en tándem en múltiples locus (MLVA) y analizar las distancias génicas entre los genotipos determinados a partir de cepas aisladas de animales. Para ello, genotipificamos las 4 cepas referenciales del serogrupo Icterohaemorrhagiae de la especie Leptospira interrogans serovariedad Copenhageni cepa M20 y cepa Ictero I y de la serovariedad Copenhageni cepa RGA y cepa Fiocruz L1-130. Para este estudio se incluyeron 24 cepas aisladas de animales domésticos como silvestres. Logramos mediante esta técnica determinar un código numérico para cada serovariedad y así pudimos discriminar entre las serovariedades de este serogrupo. El análisis de coordenadas principales (PCoA) demostró la variabilidad génica existente entre las 4 cepas referenciales pertenecientes al serogrupo Icterohaemorrhagiae, el genotipo con mayor representación fue el serovar Copenhageni cepa Fiocruz L1-130 con un total de 13 cepas aisladas con ese perfil genético. Discriminar las serovariedades de este importante serogrupo nos permitirá en un futuro investigar si existen diferencias entre la sintomatología clínica y/o respuesta al tratamiento en los casos clínicos producidos por las distintas serovariedades del serogrupo Icterohaemorrhagiae discriminadas en este trabajo.

Leptospirosis is the world`s most widely distributed zoonosis and of great importance in animal health and in public health. The relevance of the serogroup Icterohaemorrhagiae relies on the frequent isolation from rodents and from clinical cases of humans, canines, bovines and swine; and this serogroup was also isolated from water samples of the Reconquista river, Buenos Aires province, Argentina. The objective of this study was to discriminate molecularly between serovars Copenhageni and Icterohaemorrhagiae being of importance in Argentina, using Multiple Locus Variable number tandem repeats analysis (MLVA) and analyzing the genetic distances among genotypes obtained from animal isolates in this study. We genotyped the four referential strains of the serogroup Icterohaemorrhagiae belonging to the species Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain M20 and strain Ictero I and of the serovar Copenhageni strain RGA and strain Fiocruz L1-130. In this study we included 24 strains isolated from animals domestic and wildlife. Using this technique we could determine numeric codes for each serovar and in this way, discriminate between serovars of this serogroup. The principal coordinates analysis (PCoA) showed the genetic variability of the four referential strains from the serogroup Icterohaemorrhagiae, the genotype with better representation was serovar Copenhageni strain Fiocruz L1-130 with 13 isolated strains with this genetic profile. Discrimination of the serovars from this important serogroup allows to establish differences between clinical signs and/or response to treatment in the clinical cases produced by different serovars of the serogroup Icterohaemorrhagiae successfully distinguished in this study.

Genotipificación y estudio de los genes pauA y sua de aislamientos de Streptococcus uberis de mastitis bovina / Genotyping and study of the pauA and sua genes of Streptococcus uberis isolates from bovine mastitis

This study aimed to determine the clonal relationship among 137 Streptococcus uberis isolates from bovine milk with subclinical or clinical mastitis in Argentina and to assess the prevalence and conservation of pauA and sua genes. This information is critical for the rational design of a vaccine for the prevention of bovine mastitis caused by S. uberis. The isolates were typed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis and by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The 137 isolates exhibited 61 different PFGE types and 25 distinct RAPD profiles. Simpson's diversity index was calculated both for PFGE (0.983) and for RAPD (0.941), showing a high discriminatory power in both techniques. The analysis of the relationship between pairs of isolates showed 92.6 % concordance between both techniques indicating that any given pair of isolates distinguished by one method tended to be distinguished by the other. The prevalence of the sua and pauA genes was 97.8 % (134/137) and 94.9 % (130/137), respectively. Nucleotide and amino acid sequences of the sua and pauA genes from 20 S. uberis selected isolates, based on their PFGE and RAPD types and geographical origin, showed an identity between 95 % and 100 % with respect to all reference sequences registered in GenBank. These results demonstrate that, in spite of S. uberis clonal diversity, the sua and pauA genes are prevalent and highly conserved, showing their importance to be included in future vaccine studies to prevent S. uberis bovine mastitis.

Este estudio pretendió determinar la relación clonal entre 137 aislamientos de S. uberis obtenidos de leche de bovinos con mastitis clínica o subclínica en la Argentina, como así también la prevalencia y la conservación de los genes sua y PauA entre dichos aislamientos. Esta información es crítica para el diseño racional de una vacuna que prevenga la mastitis bovina por S. uberis. Los aislamientos se tipificaron molecularmente por amplificación al azar del ADN polimórfico (RAPD) y mediante electroforesis de campos pulsados (PFGE). Los 137 aislamientos mostraron 61 pulsotipos mediante PFGE y 25 tipos de RAPD diferentes. Los índices de Simpson calculados fueron 0,983 por PFGE y 0,941 por RAPD; esto evidencia el elevado poder discriminatorio de ambas técnicas. El análisis de la relación entre pares de aislamientos mostró un 92,6 % de concordancia entre ambas técnicas, lo que indica que cualquier par de aislamientos que fue distinguido por un método tendió a ser distinguido por el otro. La prevalencia de los genes sua y puaA fue del 97,8 % (134/137) y 94,9 % (130/137), respectivamente. Las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos codificados por los genes sua y pauA de los 20 aislamientos de S. uberis seleccionados sobre la base de su tipo de PFGE y RAPD y origen geográfico tuvieron un porcentaje de identidad de entre 95 % y 100 % con respecto a todas las secuencias de referencia registradas en GenBank. Estos resultados demuestran que, a pesar de la diversidad clonal de S. uberis, los genes sua y pauA son prevalentes y están altamente conservados y deberían ser incluidos en futuros estudios de vacunas para prevenir mastitis bovina causada por S. uberis.

Caracterización molecular de un brote de Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenémicos en un hospital de alto nivel de complejidad de Medellín, Colombia / Molecular characterization of an outbreak of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae in a tertiary care hospital in Medellín, Colombia

Introducción. La resistencia a los carbapenémicos constituye una seria amenaza para la salud pública a nivel mundial, ya que estos antibióticos son una de las últimas opciones terapéuticas contra las bacterias multirresistentes. La caracterización molecular de los brotes causados por bacterias resistentes aporta información relevante para el diseño de estrategias de control de infecciones. Objetivo. Describir las características moleculares de un brote de Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenémicos ocurrido en un hospital de alto nivel de complejidad de Medellín entre 2010 y 2011. Materiales y métodos. A partir de una colección de cepas del brote ocurrido en la institución hospitalaria, se recuperaron 84 aislamientos de 32 pacientes infectados y 52 colonizados. La identificación y la sensibilidad de los aislamientos se establecieron mediante el sistema Vitek2 ® . La detección de carbapenemasas se hizo mediante el test de Hodge modificado y usando la reacción en cadena de la polimerasa. La relación genética entre los aislamientos se evaluó mediante electroforesis en gel de campo pulsado y tipificación de secuencias de locus múltiple. Resultados. Todos los aislamientos analizados fueron multirresistentes; el análisis molecular reveló que todos eran portadores del gen bla KPC-3 . El análisis genético mostró que los aislamientos de pacientes infectados y colonizados (58/64 aislamientos) estaban estrechamente relacionados (>80 %) y pertenecían al linaje ST258. Conclusión. Mediante el empleo de técnicas de tipificación molecular fue posible confirmar un brote ocasionado por K. pneumoniae ST258 portador del bla KPC-3 con un perfil de multirresistencia, el cual había sido asociado a uno anterior ocurrido en otro hospital de Medellín. El ST258 es un clon de alto riesgo presente a nivel mundial, lo que debe alertar sobre la posible diseminación de resistencia en el país. El empleo de herramientas moleculares en la vigilancia epidemiológica, es útil para evaluar la diseminación de microorganismos de interés en salud pública.

Introduction: Resistance to carbapenems is considered to represent a serious threat to public health at the global level, since these antibiotics are one of the last therapeutic options for the treatment of multidrug-resistant bacteria. Molecular characterization of outbreaks due to resistant bacteria provides information that can be used in the design of infection control strategies. Objective: To describe the molecular characteristics of an outbreak of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae that occurred in a tertiary care hospital in Medellín in 2010-2011. Materials and methods: Eighty-four isolates were obtained from a collection of strains associated with the hospital outbreak, of which 32 were from patients infected at that time and 52 were carriers. Identification and susceptibility of the isolates was performed using Vitek2 ® . Carbapenemases were detected using a modified Hodge test and polymerase chain reaction. Genetic relationships between the isolates were evaluated using pulsed field gel electrophoresis and multiple locus sequence typing. Results: All the isolates analyzed were multidrug resistant; molecular analysis revealed that all harbored bla KPC-3 . The genetic analysis showed that 58/64 of the isolates from both infected and colonized patients were closely related (Dice similarity index >80%) and belonged to the ST258 lineage. Conclusion: Using molecular typing techniques it was possible to confirm the occurrence of an outbreak caused by K. pneumoniae ST258, a carrier of bla KPC-3 with a multidrug-resistant profile which had been associated with a previous outbreak in another hospital in the city of Medellín. ST258 is a high risk clone at the global level, demonstrating the potential for dissemination of resistance in this country. Implementation of molecular tools in support of epidemiological surveillance is useful for evaluating the spread of microorganisms of public health significance.

Análisis genotípico de aislamientos de Mycobacterium tuberculosis en La Habana en 2009 / Genotyping of mycobacterium tuberculosis isolates in Havana, 2009

INTRODUCCIÓN: la búsqueda de alternativas al polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP, siglas en inglés) con la sonda IS 6110 en la genotipificación de Mycobacterium tuberculosis ha propiciado el desarrollo de la tipificación con número variable de repeticiones en tándem de unidades repetitivas interespaciadas de micobacterias (MIRU-VNTR, siglas en inglés). OBJETIVO: evaluar la diseminación de genotipos de M. tuberculosis en La Habana en 2009. MÉTODOS: se estudiaron 80 aislamientos procedentes de unidades de salud durante 2009 y se caracterizaron por tipificación MIRU-VNTR-15. Los genotipos se expresaron como códigos numéricos según el número de copias de cada MIRU-VNTR amplificado, y se analizaron con la herramienta bioinformática en línea MIRU-VNTR plus. Se utilizó MIRU-VNTR-24 como tipificación secundaria en los aislamientos agrupados por MIRU-VNTR-15. RESULTADOS: con MIRU-VNTR-15 se definieron 41 genotipos diferentes; entre ellos, 33 únicos (41,25 por ciento), y ocho que agruparon a 47 aislamientos (58,75 por ciento). La tipificación MIRU-VNTR-24 logró diferenciar sólo el 5 por ciento de éstos, disminuyendo el porcentaje de agrupamiento a 53,75 por ciento. CONCLUSIONES: el elevado agrupamiento encontrado sugirió transmisión reciente, lo que pudo tener influencia en la incidencia de tuberculosis en La Habana en 2009(AU)

INTRODUCTION: the search for alternatives to restriction fragment length polymorphism (RFLP) with the IS6110probe for the genotyping of Mycobacterium tuberculosis has paved the way for the development of mycobacterial interspersed repetitive-unit-variable-number tandem-repeat typing (MIRU-VNTR). OBJECTIVE: evaluate the spread of M. tuberculosis genotypes in Havana in 2009. METHODS: eighty isolates obtained from healthcare centers during 2009 were examined and characterized by 15-loci MIRU-VNTR typing. The genotypes were expressed as numerical codes according to the copy number of each amplified MIRU-VNTR, and they were analyzed with the online bioinformatic tool MIRU-VNTR plus. 24-loci MIRU-VNTR was used for secondary typing of isolates grouped by 15-loci MIRU-VNTR. RESULTS: forty-one different genotypes were defined with 15-loci MIRU-VNTR. Of these, 33 were single (41.25 percent), whereas 8 clustered 47 isolates (58.75 percent). Only 5 percent of the latter could be differentiated by 24-loci MIRU-VNTR, lowering the percentage of clustering to 53.75 percent. CONCLUSIONS: the high clustering values revealed by the study suggest that transmission was recent. This may have had an influence on the incidence of tuberculosis in Havana in 2009(AU)

Detección de un complejo clonal con el genotipo de Brucella abortus biovariedad 2 como fundador en aislamientos de B. abortus de Argentina / Detection of a clonal complex with Brucella abortus biovar 2 genotype as founder in B. abortus isolates from Argentina

Brucella abortus es el agente causal de la brucelosis bovina, enfermedad zoonótica que se encuentra ampliamente distribuida en el mundo. Actualmente existen ocho biovariedades de B. abortus. En Argentina se encuentra con mayor frecuencia la biovariedad 1, pero también se suele aislar la biovariedad 2, que es más patogénica que la anterior. Resulta necesario contar con métodos de tipificación que tengan la resolución suficiente para permitir el seguimiento epidemiológico de los brotes de brucelosis y de los programas de control de la enfermedad. Debido a la gran homogeneidad genética que existe entre las distintas especies del género Brucella, ha sido dificultoso el desarrollo de herramientas moleculares para realizar el análisis epidemiológico de los aislamientos. La publicación del genoma de varias especies de Brucella facilitó el diseño de estas herramientas. El objetivo del presente trabajo fue emplear un esquema de análisis multilocus de VNTR en aislamientos de Argentina obtenidos en nuestro laboratorio. De los 56 aislamientos analizados se obtuvieron 47 perfiles genotípicos diferentes. El empleo de este esquema permitió asignarles a dichos aislamientos la biovariedad correspondiente. A través del análisis goeBURST se pudo relacionar a todos los genotipos entre sí, y además, proponer al genotipo de la biovariedad 2 como fundador.

Brucella abortus is the causative agent of bovine brucellosis, a worldwide zoonosis. Up to date, eight biovars of B. abortus have been described. In Argentina, biovar 1 is the most frequently isolated. However, biovar 2, which is more pathogenic than biovar 1, is also found. Molecular methods for subtyping isolates are necessary for allowing epidemiological surveillance and control of eradication programs. Due to the genetic homogeneity of the genus Brucella, the development of molecular typing tools has been difficult. The publication of microorganism genomes facilitates the design of this approach. The aim of this work was to employ a Multiple Locus VNTR Analysis (MLVA) scheme for strains from Argentina isolated in our laboratory. From the 56 isolates analyzed, 47 different genotypic profiles were obtained. All the strains typed as biovar 2 showed the same profile. This scheme allowed assigning each isolate to the biovar it belongs to. All the genotypes were related using the goeBURST analysis and biovar 2 was proposed as founder.

Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE) para la diferenciación molecular de Listeria monocytogenes / Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) for the molecular differentiation of Listeria monocytogenes

En Colombia no es obligatoria la notificación deL. monocytogenes en alimentos, pero se vigilan los alimentos dealto riesgo. Clínicamente se reportan como microorganismoGram-positivo sólo cuando causan meningitis. L. monocytogeneses un patógeno intracelular, transmitido por alimentos, letalpara humanos y animales, que causa Listeriosis; enfermedadque genera varios brotes en el mundo, con pérdidashumanas y económicas. Pocos trabajos en Colombia hanlogrado identificar y serotipificar molecularmente losaislamientos, lo que sólo permite distribuir teóricamentelos serotipos en linajes. Esta revisión se limita a mostrarcaracterísticas del patógeno, su importancia en salud públicay en la industria de alimentos, generalidades de la PFGECHEF;identificando el protocolo estandarizado de trabajoy las enzimas de restricción adecuadas para cortar el ADN.Se encontró que la combinación de enzimas XbaI-AscI,seguida de ApaI es la que ofrece mejores resultados en ladiferenciación de los aislamientos; agrupándolos por linajes;mostrando variaciones intra-serotipo y que en varios paíseslatinoamericanos se analizan los resultados a través dePulseNet, lo que garantiza la comparación de los patronesde PFGE en igualdad de condiciones...

The reporting of L. monocytogenes in food in Colombia is not a mandatory; however, foods consideredhigh-risk are monitored, and the organism is only reported clinically as Gram-positive when it causesmeningitis. L. monocytogenes is a foodborne, intracellular, pathogen which causes listeriosis, a disease lethalto humans and animals. Outbreaks of this disease worldwide can bring about human and economiclosses. Only a few studies in Colombia have been able to identify and molecularly serotype isolatesallowing only the theoretical distribution of serotypes by lineage. This review explains the characteristicsof the pathogen, its importance in public health and in the food industry, and provides an overview ofPFGE-CHEF; identifying the standard work protocol and the appropriate restriction enzymes to cutDNA. We found that the enzyme combination, XbaI-AscI, followed by ApaI offers the best results todifferentiate isolates, by grouping them by lineages, and displaying intra-serotype variations. Additionally,we found that in several Latin American countries the results are analyzed using PulseNet; this ensuresthe comparison of PFGE patterns in equivalent conditions...

Na Colômbia não há uma notificação compulsóriade L. monocytogenes em alimentos, mas alimentos de altorisco são monitorados. Clinicamente, são relatados comoorganismos Gram-positivos apenas quando eles causammeningite. L. monocytogenes é um patógeno intracelularde origem alimentar, letal para seres humanos e animais,que causa a listeriose, que gera surtos em todo o mundo,com perdas humanas e econômicas. Poucos trabalhos naColômbia identificaram e sorotipificaram molecularmenteos isolados, que só permite a distribuição de sorotiposteoricamente em linhagens. Esta avaliação é limitada amostrar características do patógeno, sua importância nasaúde pública e na indústria de alimentos, e uma visãogeral do PFGE-CHEF; identificar o protocolo-padrão detrabalho e enzimas de restrição apropriadas para cortar oADN. Verificou-se que a combinação de enzimas XbaIAscI,seguido por ApaI representa a combinação de enzimasque ofereceu melhores resultados na diferenciação dosisolados, agrupando-a por linhagens, mostrando a variaçãointra-serotipo e que, em muitos países da América Latina,os resultados são analisados através PulseNet, que asseguraa comparação de padrões de PFGE em igualdade decondições...

Epidemiología molecular del Virus del Papiloma Humano detectado en cuello uterino de mujeres indígenas del Departamento de Presidente Hayes -Paraguay, periodo 2010-2011 / Molecular epidemiology of human papillomavirus in cervical detected indigenous women Presidente Hayes department, Paraguay, period 2010-2011

El Paraguay ocupa el séptimo lugar en incidencia de cáncer de cuello uterino en las Américas y el caribe, siendo el virus del papiloma humano (HPV) suagente causal. Considerando que las mujeres indígenas poseen menor acceso a sistemas de salud, inicio temprano de relaciones sexuales, bajo nivel de educación, características que podrían favorecer el desarrollo de lesiones cervicales, el objetivo del presente estudio transversal analítico fue, determinar la frecuencia de tipos de HPV y lesiones de cuello uterino en 181 mujeres índigenas del Departamento de Presidente Hayes - Paraguay, periodo 2010/2011. Las mujeres pertenecieron a las siguientes etnias: Maká (n=39); Nivaclé (n=18); Sanapaná (n=33); Enxet Sur (N=57) y Toba-Qom (n=34). Los tipos de HPV se detectaron por reacción en cadena de la polimerasa seguida de hidridación reversa y las lesiones de cuello uterino, por citología. La frecuencia de HPV fue 23,2% (42/181 mujeres). En 9,4% de las mujeres (17/181) se observó infección múltiple. El HPV 16 (4,4%) fue el más frecuente seguido por HPV 58 (3,3%, HPV 45 (3,3%), HPV 53 (",8%) y HPV 11 (",8). No se observó lesión de cuello uterino. Hubo asociación estadísticamente significativa entre la presencia de infección por HPV, un inicio temprano de relaciones sexuales (p=0,018) y un número de parejas sexuales mayor a 2 (p=0,028). Los datos obtenidos permitieron conocer los tipos de HPV circulantes en la población, lo cual contribuirá a la vigilancia de estos post vacunación y a optimizar las Poliíticas de Salud Pública destinadas a la detección y prevención del cáncer.

Farmacogenética: hacia la individualización de la terapia farmacológica en Costa Rica / Pharmacogenetics: toward the individualization of pharmacologic therapy in Costa Rica

La "era posgenómica" ha impactado las ciencias biológicas y biomédicas desde la identificación de un significativo componente de variabilidad genética interindividual. La farmacología no escapa a esta realidad, y esta ciencia, en conjunto con la toxicología, ya desde hace varios años desarrollados campos como la farmacogenética y la farmacogenómica. Dichas disciplinas estudian la influencia de la variabilidad gen‚tica de la población respecto a la respuesta que se tiene ante el contacto con los fármacos y las sustancias tóxicas. Las variantes genéticas, reflejadas en el polimorfismo de los genes, tienen implicaciones en el manejo de xenobióticos en el organismo y además determinan las respuestas aumentadas, normales disminuidas durante la administración de algunos fármacos. Muchos genes se relacionan con reacciones adversas y fallas terapéuticas de fármacos administrados a dosis predeterrminadas y siguiendo protocolo establecidos. Es por esto que las herramientas de caracterización genética molecular se aplican en muchos países con el fin de adaptar estos protocolos a cada individuo, es decir, personalizar la terapia farmacológica, donde las dosificaciones son evaluadas de acuerdo con las características genéticas de la persona, para evitar o prevenir reacciones adversas en individuos predispuestos. Costa Rica es un país que hace grandes esfuerzos para brindar una atención médica de primer mundo a sus habitantes, sin embargo, el campo de farmacogenética aún no se ha desarrollado en nuestro medio. No obstante, el Centro Nacional Innovaciones Biotecnológicas financia un proyecto pionero junto con la Universidad de Costa Rica, para desarrollar la aplicación de esta disciplina en el país. El presente artículo presenta las bases biológicas y la utilidad clínica de farmacogenética, así como detalles de las iniciativas para el desarrollo de esta disciplina en Costa Rica...